VEGFR-2蛋白与其抑制剂的分子动力学模拟以及结合自由能计算
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  • 作者:王宇 ; 罗勇锋
  • 关键词:VEGFR-2蛋白 ; 抑制剂
  • 中文刊名:TXWL
  • 英文刊名:China New Telecommunications
  • 机构:中南林业科技大学理学院;
  • 出版日期:2019-03-20
  • 出版单位:中国新通信
  • 年:2019
  • 期:v.21
  • 语种:中文;
  • 页:TXWL201906207
  • 页数:1
  • CN:06
  • ISSN:11-5402/TN
  • 分类号:248
摘要
VEGFR2蛋白是抗肿瘤治疗中的一个重要靶点,针对该靶点设计新型抑制剂是具有重要的生理意义。本文采用了分子动力学模拟取样,结合MM/GBSA方法计算了小分子900和VEGFR-2之间的结合自由能,并进一步进行了能量分解。研究结果表明,体系范德华作用是驱动小分子900和VEGFR-2蛋白结合的主要驱动力。能量分解结果表明,结合过程中的关键氨基酸大多数都是疏水性氨基酸。期望我们的研究可以为设计具有潜力的VEGFR-2抑制剂提供帮助。
        
引文
[1]L.M.Ellis and D.J.Hicklin,Nat Rev Cancer,2008,8,579-591.
    [2]J.C.Harmange,M.M.Weiss,J.Germain,et.al.,J Med Chem,2008,51,1649-1667