辣椒抗南方根结线虫基因同源序列的克隆与分析
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摘要
根结线虫(Meloidogyne spp.)病是辣椒(Capsicum annuum L.)的重要病害之一,选育和推广抗病品种是防治该病最经济、有效、安全的方法,利用基因工程技术获得抗病基因是一条新的抗病育种途径。本试验根据已克隆植物抗病基因的NBS(Nucleotide binding site)保守区域设计简并引物,对来源于广西的抗南方根结线虫野生辣椒材料基因组进行体外扩增,获得约500bp的预期片段;克隆获得12条具有完整开放阅读框(ORF)和NBS-LRR结构域的序列。聚类分析结果显示,L-6、L-10、L-11、L-16和L-18这5条RGAs(Resistance-gene analogs)与番茄抗胞囊线虫基因Hero、番茄抗丁香假单孢菌基因Prf、番茄抗根结线虫基因Mi聚为一类,这3个基因为NBS-LRR基因;同源性分析表明,这12条RGAs与已知抗病基因相应区域的氨基酸序列的相似性为21%~78%,其中L-6与Mi相应区域氨基酸相似性为78%,表明L-6可作为抗根结线虫基因的候选材料。本研究发现的RGAs为分子标记辅助育种和功能性抗病相关基因的克隆奠定了基础。
引文